内科学のなかで，循環器，呼吸器，腎・膠原病に関する基礎的並びに臨床的研究を行っている。
（１）心筋梗塞，慢性閉塞性肺疾患(COPD)，糖尿病性腎症の分子疫学研究
（２）心肥大・心不全・動脈硬化に関する細胞内情報伝達系の解明
（３）超音波による心血管病の病態解明（脳卒中，動脈硬化，心筋組織診断）
（４）COPD 運動耐容能の生理学的研究
（５）腎不全における酸化ストレスと生体防御反応
（６）遺伝子改変動物実験によるCOPD の病態解明
（７）分子疫学的手法による慢性腎臓病進行機序の解明


・内科学第一（循環・呼吸・腎臓内科学）講座のサイトへ

（１）ウイルス肝炎の病態解析と感染防御に関わる遺伝子多型の研究
（２）ウイルス肝炎からの肝細胞癌発症の分子機構解明に関する研究
（３）非ウイルス性肝疾患の病態形成に関する研究
（４）急性膵炎発症の分子機構の解明と治療法の開発
（５）膵・胆道癌の分子機構と新規の治療法の開発
（６）炎症性腸疾患の発症機構の解明と治療法の開発
（７）胃・食道癌の内視鏡治療と長期予後改善のための研究
（８）消化器がんの生物学的特性の解析と分子標的治療法の開発
（９）メタボリックシンドロームからの発がん予防


・内科学第二（消化器内科学）講座のサイトへ

(１)　新しい抗がん剤並びに分子標的薬の併用療法の開発
(２)　新しい集学的治療法（化学療法と放射線療法の併用など）の開発
(３)　抗がん剤の作用機序・副作用発現メカニズムの解明
(４)　分子標的治療薬の作用機序・副作用発現メカニズムの解明
(５)　抗腫瘍薬の新しい効果評価法の開発
(６)　抗腫瘍薬の適応診断法の開発
(７)　新規抗がん薬の開発につながるトランスレーショナルリサーチ


・内科学第二（臨床腫瘍学）講座のサイトへ

　脳神経内科は，脳・脊髄・末梢神経・筋肉まで全身に広がる神経系の疾患を対象としています。 神経疾患は多彩な機能障害をきたし，日常生活に大きな影響を与えることが特徴で，中でも認知症は大きな社会問題になっています。 本講座では分子疫学研究，神経画像研究，神経心理学的研究などを組合せ，神経科学的視点も取り入れて，以下のような研究を行っています。
（１）パーキンソン病とその類縁疾患，アルツハイマー病，正常圧水頭症、筋萎縮性側索硬化症など神経変性と認知症を来しうる疾患の分子病態の解明および新規治療法開発に関する研究
（２）器質性脳損傷における高次脳機能障害の解明および治療に関する研究
（３）地域在住高齢者における認知機能の変化および認知症発症関連因子に関する研究

・内科学第三（神経学）講座のサイトへ

（１）長期にわたる糖尿病住民検診データをもとに，糖尿病や生活習慣病の発症に関わる危険因子についてコホート研究を行う。分子疫学研究の手法を用いて遺伝体質と糖尿病発症の関連性について探求する。
（２）糖尿病の病因遺伝因子の解析及びその病態に関与する諸因子の解析。遺伝性代謝疾患，特にポルフィリン症，セルロプラスミン欠損症の病因病態の解析。

・内科学第三（糖尿病・内分泌代謝学）講座のサイトへ

（１）造血器疾患，特に多発性骨髄腫，悪性リンパ腫および白血病の病態の解析
（２）造血幹細胞移植における生着，急性移植片対宿主病および慢性移植片対宿主病の発症メカニズムの解析

・内科学第三（血液・細胞治療内科学）講座のサイトへ

（１）人格特徴に与える遺伝・環境要因の影響
（２）向精神薬の薬理遺伝，薬理ゲノミクス，薬物相互作用
（３）精神疾患の病因・病態に関する分子遺伝的研究
（４）精神疾患の画像所見と神経心理
（５）注意欠陥／多動性障害などの児童青年期患者の診断と治療
（６）精神病理学


・精神医学講座のサイトへ

　小児科の診療・研究対象は，新生児疾患，神経疾患，内分泌・代謝異常，血液・腫瘍性疾患，循環器疾患，腎疾患など多岐に亘っているが，主に遺伝的負荷と疾患との関係を基礎的研究テーマとしている。 　新生児疾患では，先天性中枢性低換気症候群の病態の解析に取り組み，国内の多くの症例の遺伝子診断を行っている。代謝疾患に関しては，日本人で頻度の高いシトリン欠損症に対して中鎖脂肪酸補充療法を開発し， 良好な結果を得ている。血液・腫瘍性疾患に関しては，好中球減少症白血病化への病態研究，白血病化機序の病態解析を行っている。腎疾患では，山形県に多く認められるリポ蛋白糸球体症の病態および疫学研究， また，難治性ネフローゼの遺伝子背景の検索を行っている。
　臨床的テーマとしては，各系統の難治疾患の臨床試験を通じて臨床研究に取り組んでいる。

・小児科学講座のサイトへ

　消化器疾患，すなわち食道・胃・小腸・大腸・直腸などの消化管および肝胆膵脾などの実質臓器の疾患，乳腺・甲状腺の病態，治療に関する基礎的並びに臨床的研究を行っている。常に外科臨床の立場を離れることのないように十分留意しつつ研究を進めている。主な内容について以下に示す。
（１）膵臓の神経浸潤に関する研究：膵癌の予後決定因子として神経浸潤が重要である膵内および膵近傍の神経線維の分布を組織学的に検索する。
（２）粘液産生膵腫瘍の分子病態的研究，MUC 染色や遺伝子変化を検索して，癌化や浸潤について調べる。
（３）胃，食道，大腸癌に対する腹腔鏡手術と生体侵襲度の研究を行う。
（４）乳癌の診断と治療：従来の診断装置に加え，MRI，99Tc-MIBI scintiなどを用いて癌の広がりを詳細にとらえると共に，術後の摘出標本の全割標本からその病理学的特徴を検討する。
（５）消化器癌の集学的治療：癌の悪性度，抗癌剤感受性試験に基づいた効果的な化学療法について検討する。
（６）門脈塞栓術後の肝機能に関する研究：大量肝切除には術前門脈塞栓術が施工されるが，肝容積の肥大と肝機能の関連についてアシアロシンチなどを用いて検討する。


・外科学第一（消化器・乳腺甲状腺・一般外科学）講座のサイトへ

（１）外科治療周術期における感染対策と危険因子の検討
（２）大動脈弁及び大血管の石灰化病変の発生機序と外科治療法の開発
（３）患者負担（肉体的苦痛，精神的苦痛，経済的問題）を軽減可能な手術法開発を目指す。具体的には小切開の傷口から安全に手術を行う方法。
　　体外循環装置を用いず心臓手術を行う手術法開発。内視鏡を用いて切を加えず手術を行う方法の開発。
（４）胸腔鏡手術における新しい器具の開発と評価
（５）外科療法における画像支援の開発と応用
（６）胸腔鏡下肺区域切除術の開発と腫瘍学的意義の検討


・外科学第二（心臓血管・呼吸器・小児外科学）講座のサイトへ

　脳神経外科の対象疾患は，脳腫瘍・脳血管障害・機能的脳神経外科・先天奇形・てんかん・脊椎脊髄・頭部外傷など非常に幅広く多岐にわたります。 特に、脳腫瘍の中で膠芽腫は最も悪性で、その治療成績は未だ満足のいくものではありません。その発生メカニズムの解明・治療成績向上を目指した分子生物学的研究が当教室のメインテーマであります。 また、今後さらなる高齢化に伴い，要介護の主原因である脳卒中，特に脳梗塞患者は増加の一途ですが、その後遺症による機能障害からの回復を目指した， 神経再生に関する研究や虚血性脳血管障害における¹⁵O-PET を用いた脳循環代謝に関する研究も行っております。

・脳神経外科学講座のサイトへ

（１）人工関節の生体親和性に関する研究：i)人工関節周囲の骨融解，ii)人工関節周囲の骨質，iii)人工関節素材に対する細胞性反応，iv)人工関節素材のバイオメカニクス，v)人工関節周囲の自然免疫機構
（２）四肢発生並びに骨関節腱損傷の修復に関する研究：i)関節の発生と分化，ii)リウマチ性関節炎の分子機構，iii)腱修復の分子生物学
（３）成長因子とドラッグデリバリーシステムを用いた半月板修復に関する研究：半月板細胞を成長因子により活性化し，効率的な修復を行うことを目的に家兎モデルを用いた研究を行っている。 従来の方法では対応不能な，また効果が不十分な病態に対し，新しい術式やシステムを開発し，i)生体力学的強度，ii)臨床成績における成績を問題点について基礎，臨床の両面から研究を行っている。
（４）体性幹細胞を用いた骨再生に関する研究：体性幹細胞を用い，骨癒合促進因子を併用した細胞移植法により，自家骨に替わり得る方法の開発を行っている。 幹細胞の増殖，分化を効果的に誘導する方法について動物実験モデル，細胞培養により分子生物学的に基礎研究を行っている。


・整形外科学講座のサイトへ

（１）遺伝性色素異常症の病態，遺伝子診断，原因遺伝子の機能解析
（２）皮膚悪性腫瘍の病態，診断，新しい治療法開発
（３）皮膚悪性腫瘍の発症リスクに関わる遺伝子に関する研究
（４）皮膚色調を決定している遺伝子に関する研究
（５）色素細胞における細胞内輸送の研究


・皮膚科学講座のサイトへ

　以下の泌尿器科疾患を中心に，その詳細な病態の解明とより適切な治療法の選択や新たな治療法の開発につながる研究を行っている。
　（１） 泌尿器科悪性腫瘍
　（２） 慢性腎不全に対する腎移植
　（３） 神経因性膀胱等による排尿障害
　（４） 副腎を中心とする内分泌疾患およびアンドロロジー領域の疾患


・腎泌尿器外科学講座のサイトへ

眼疾患の病態，診断，治療に関する基礎的，臨床的研究を行っている。
（１）網膜疾患の病態，診断，治療研究
　　　糖尿病網膜症の疫学，分子遺伝学，分子細胞生物学的研究
　　　網膜硝子体疾患手術の精度向上
　　　網膜硝子体疾患診断法の研究
　　　加齢黄斑変性症の診断と新しい治療法　
　　　生活習慣病における網膜血管疾患の分子病態と治療戦略
（２）眼腫瘍の病態，診断，治療
　　　眼腫瘍の分子病態の研究
（３）角膜，眼表面再生医療の研究
　　　角膜疾患の分子細胞生物学的研究
（４）眼科領域での手術全般についての研究，分子疫学的研究
（５）緑内障治療戦略の研究
（６）小児眼疾患の病態と治療研究
（７）視神経乳頭画像解析法の開発，治療薬の臨床薬理学的研究
（８）眼疾患のテーラーメード医療を目指した分子疫学研究


・眼科学講座のサイトへ

（１）内視鏡下耳科手術の開発および基礎的研究：低侵襲な聴力改善手術の開発と，新規手術支援器機の内耳へ及す影響の解明。
（２）中耳・内耳の再生医療のための基礎的研究。
（３）聴性誘発反応の基礎的ならびに臨床的研究：聴性定常反応の自動判定システムの開発と新生児・乳幼児の聴力判定への導入についての研究，およびヒト聴性定常反応の発生起源に関する研究。
（４）頭頸部悪性腫瘍の基礎的ならびに臨床的研究：頭頸部扁平上皮癌のリンパ節転移機構の解明，および機能温存を目的とした集学的治療の開発。
（５）顔面神経麻痺の基礎的ならびに臨床的研究：神経再生を目指した基礎的研究と、再生医療のトランスレーショナルリサーチを行っている。また、適切な治療法確立のための他施設共同研究を実施している。


・耳鼻咽喉・頭頸部外科学講座のサイトへ

　近年飛躍的に発展している画像診断技術（CT，MRI，血管造影，核医学，等）を臨床に応用するとともに，新たな技術を開発して各種疾患の病態解明を行う。また，患者にやさしく治療効果の高いInterventional Radiology（IVR） には今後さらなる発展が求められており，基礎的，臨床的研究を通して医療に 貢献する。
　（１）MRI を用いた脳白質線維と深部灰白質の画像解剖
　（２）ボリュームデータの画像解析技術および画像処理技術の開発と臨床応用
　（３）核医学PET/SPECT 解析による脳代謝，肝機能評価法の開発と臨床応用
　（４）IVR 技術の開発と臨床応用
　（５）ナビゲータ機能を備えたIVR・血管撮影装置の開発
　（６）CT，PET の被曝低減化対策


・放射線医学（放射線診断学）講座のサイトへ

（１）重粒子線の放射線生物学
（２）新しい化学放射線療法の開発
（３）放射線抵抗性メカニズムの解明
（４）化学放射線療法に対する癌の反応予測法の開発
（５）体内スペーサー，新たな照準法などの高精度放射線治療に関する新技術の開発
（６）従来治療が困難であった晩期放射線障害の治療法開発


・放射線医学（放射線腫瘍学）講座のサイトへ

　�@「婦人科腫瘍」，�A「生殖生理」，�B「女性ヘルスケア」と�C「周産期」がおもな研究テーマです。基礎研究体制も医局内で整えることを重要視しています。
研究テーマ：
�T．「婦人科腫瘍」に関する臨床および基礎研究
（１）臨床研究：悪性腫瘍の患者さんが多く，多くの悪性腫瘍手術を行うとともに，とくに卵巣癌の化学療法などの臨床研究を積極的に行っています。各種臨床研究グループに加わり，患者さんの登録・治療でも実績を積んでいます。
（２）基礎研究：婦人科癌の薬剤耐性化の分子メカニズム，分子標的治療の開発，癌幹細胞，酸化ストレスと婦人科癌に関する研究等を行っています。
（３）疫学研究：山形県全域の婦人科癌登録
�U．「生殖内分泌学」に関する臨床および基礎研究
（１）臨床研究：難治性不妊症に対して，体外受精・胚移植治療などの生殖補助技術を用いた治療ばかりでなく，腹腔鏡および卵管鏡を用いた内視鏡下治療を積極的に行っています。
（２）基礎研究：卵成熟機構や卵の老化の分子メカニズムについての研究を行っています。また，核内受容体転写調節因子の子宮内膜増殖調節メカニズムについての研究を行っています。
�V．「中高年女性の健康ケア」に関する臨床および基礎研究
（１）臨床研究：Surgical menopause が「脂質異常症」，「肥満」，「インスリン抵抗性」，「動脈硬化」に及ぼす影響について研究しています。内臓脂肪および皮下脂肪における機能の差異と女性ホルモンとの関係についても研究しています。
（２）基礎研究：血管内皮機能に及ぼすエストロゲン，プロゲスチンの影響を細胞内シグナル伝達や蛋白発現の面から解析しています。
（３）疫学研究：人口の異動が少ないことを生かした「疫学研究」にも力を入れています。将来，分子疫学的研究に発展させます。
�W．「周産期」に関する臨床及び基礎研究
（１）臨床研究：合併症妊娠，産科合併症や胎児の診断・治療など，関係各科と連携し病因の解明や，診断精度の向上に取り組んでいる。近年は胎児骨系統疾患の遺伝子診断について取り組んでいる。


・産科婦人科学講座のサイトへ

　手術侵襲に伴う過激な生理的変動から患者を保護することが，麻酔科学における診療と研究の主体である。そのため研究内容は，解剖学，生理学，薬理学から救急医学，集中治療医学に至るまで広範囲に及んでいる。当科では国外他施設や関連講座と共同で以下のような基礎研究ならびに臨床研究を行っている。
○基礎研究
　（１）気道確保時の気道への侵襲に関する研究
　（２）手術侵襲が肺免疫能におよぼす影響（分子生物学的解析による）
　（３）麻酔器の呼吸同調性に関する研究
　（４）人工呼吸による肺障害の研究
　（５）気管挿管チューブに関する研究
○臨床研究
　（１）麻酔臨床上の患者管理学ならびに臓器保護
　　　　−特に中枢神経系について−
　（２）周術期アミノ酸解析
　（３）鎮静薬の脳波への影響に関する研究
　（４）癌性疼痛非癌性疼痛に対するオビオイドの有用性に関する研究
　（５）麻酔・集中治療管理における自律神経活動に関する研究
　（６）周術期のモニタリングに関する研究


・麻酔科学講座のサイトへ

１．骨再生に関する基礎的・臨床的研究
（１）軟骨再生に関する基礎的研究
（２）腸骨海綿骨による顎骨・顎提再建に関する臨床的研究
（３）歯槽堤形成術に関する臨床的研究
２．唇顎口蓋裂の治療に関する研究
（１）術前外鼻矯正治療に関する研究
（２）上顎骨骨延長に関する研究
（３）顎裂部腸骨移植術に関する臨床的研究
（４）口唇外鼻二次修正術に関する研究
３．口腔腫瘍の治療と咬合再建に関する研究
（１）悪性腫瘍切除後の下顎骨再建に関する臨床的研究
（２）口腔癌治療効果の遺伝子学的検討
（３）顎骨切除後の咬合再建に関する研究
４．顎骨骨折および顎変形症における咬合治療に関する研究
５．全身疾患に影響を与える歯科疾患の治療および栄養改善に関する研究

【形成外科分野研究内容】
１．先天性外表異常に対する疫学研究
（１）新生児検診による外表異常の前向き調査研究
（２）先天性，後天性の境界型発生時期とされる外表異常の疫学調査研究
（３）形成外科学的外表異常の検診結果からの外表異常の分類と派生頻度の調査研究
（４）新生児期にみられる咬合不整の成長に伴う影響についての研究
２．再建外科に関する研究
（１）新たな四肢再建に有用な皮弁の解剖学的開発研究
（２）頭頚部特に静脈系の解剖学的研究
（３）末梢血管の動脈硬化性変化と喫煙歴，飲酒歴等嗜好歴の関係に関する研究
（４）脳神経と末梢神経の神経再生に関する比較研究
（５）術後放射線照射治療に対する移植組織の萎縮感受性の研究
３．爪甲の再生に関する研究
（１）爪甲発生に関する幹細胞の移動に関する研究
（２）爪甲組織移植に関する研究
（３）爪甲組織の分子細胞学的研究
（４）爪甲発生と指の掌背側決定因子の関係に関する研究
４．耳の発生に関する研究
（１）耳の発生に関与する幹細胞の供給経路の研究
（２）耳の成長に関するシグナルの伝達経路に関する研究
５．手指の発生に関する研究

・歯科口腔外科学講座のサイトへ

（１）人工呼吸中における呼吸生理学の研究
（２）急性呼吸窮迫症候群に対する集学的呼吸管理の検討
（３）集中治療における鎮静薬が脳波および睡眠深度に及ぼす影響
（４）人工呼吸器関連肺炎に関する研究

（１）自己免疫疾患および腫瘍免疫（甲状腺癌，大腸癌など）におけるいわゆる“樹状細胞”と濾胞樹状細胞の機能的役割の解析
（２）悪性腫瘍の脈管侵襲に関する病理学的解析
（３）胚中心を主座とする免疫反応の細胞性メカニズム
　　　−特に濾胞樹状細胞の役割についての実験的検討−
（４）悪性リンパ腫を含む網内系増殖疾患の病理学的解析
（５）各種癌の病理学的解析


・病理診断学講座のサイトへ

（１）シミュレーターを用いた医学教育プログラム開発：昨今の医療に対する社会の目は厳しく， 実際に患者に治療を施す前に，どれだけしっかりとした研修がなされているかが問われる時代となっている。 シミュレーター研修は，患者に接する前に診療技術を向上させ，患者の安全確保と確実な治療の提供のために極めて有効である。 総合医学教育センターには，内視鏡や超音波検査，腹腔鏡手術シミュレーターなど世界最新鋭の専門医教育にも対応可能な医療用 シミュレーターを有するメディカルスキルアップラボラトリーを併設しており，ハイレベルのシミュレーターを用いた教育プログラムを研究している。
（２）医療コンフリクトマネジメント・医療メディエーション教育：コンフリクトマネジメントとは，心の葛藤や利害・価値観のずれを 「上からの管理」だけでなく，「自主的にコンフリクト（葛藤）」に向き合って取り組んで行くことを意味している。また，医療メディエーションとは， 患者と医療者が向き合う場をつくり，当事者同士の対話を促進するプロセスである。以上について理論的・実践的研究を行い，医療メディエーター教育への応用を目指している。


・医学教育学（総合医学教育センター）のサイトへ

各種臨床検査の精度管理、新規検査項目の開発と評価を行っている。また、医療 関連感染の効果的な防止および制御を目的として、微生物検査や臨床感染症の サーベイランス、感染対策に関するデータ解析や文献検索、エビデンスの構築な どの研究を行っている。

生化学解析センターでは，大学院生や教職員のための教育・研究用の機器の管理・運用，使用者支援を行なっている。センターの主要機器は以下のとおりである。

（１）細胞生物学関係：透過型電子顕微鏡，共焦点レーザ顕微鏡，蛍光顕微鏡，細胞解析装置，細胞解析分取装置
（２）遺伝子・蛋白質解析機器関係：次世代シークエンサー，DNA シークエンサー，LC-MS，化学発光イメージング装置，電気泳動ゲル撮影装置，リアルタイムPCR 装置，発光・蛍光・可視光マルチプレートリーダー
（３）培養関係：組織培養実験室（組換えDNA 実験用を含む），微生物培養実験室（バイオハザード室），炭酸ガス培養装置，各種滅菌装置
（４）windows, Mac コンピュータ，大型複合機，カラープリンター


・生化学解析センターのサイトへ